Бегущий в лабиринте рассказывает о захватывающем путешествии подростка Томаса, который приходит в сознание в движущемся лифте, полностью лишенный воспоминаний о своем прошлом. Единственное, что остается в его памяти - собственное имя. Он попадает в Глейд - изолированное сообщество таких же молодых людей, сумевших создать собственные правила выживания в этом ограниченном пространстве.
Каждые тридцать дней лифт доставляет нового подростка, а каждую неделю привозит необходимые припасы. Но настоящая загадка скрывается за гигантскими стенами, окружающими их убежище - огромный, постоянно меняющийся лабиринт, полный смертельно опасных существ. Ночью врата лабиринта закрываются, защищая обитателей Глейда от угроз, скрывающихся в его запутанных коридорах.
Томас, движимый непреодолимым желанием раскрыть тайны этого места, становится первым, кто решает бросить вызов установленным правилам и проникнуть в самую суть лабиринта. Его решимость меняет привычный уклад жизни всего сообщества и открывает путь к разгадке того, почему они оказались в этой ловушке и что скрывается за ее пределами.